Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms