Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn3Q9WUK7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms