Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsbQ9WUA2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FarsbQ9WUA2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms