Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1gQ9WU39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Scnn1gQ9WU39 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Scnn1gQ9WU39 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1gQ9WU39 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Scnn1gQ9WU39 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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