Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn5Q9WU28 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms