Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6cQ9WTM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms