Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms