Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf346Q9R0B7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf346Q9R0B7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms