Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nubp1Q9R060 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nubp1Q9R060 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms