Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmfrQ9R049 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmfrQ9R049 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmfrQ9R049 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmfrQ9R049 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmfrQ9R049 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmfrQ9R049 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmfrQ9R049 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms