Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmlQ9QZD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms