Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps29Q9QZ88 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms