Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn8Q9QZ49 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms