Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms