Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd4Q9QY39 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms