Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms