Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx8Q9QXV1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms