Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms