Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdcQ9QW08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdcQ9QW08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms