Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms