Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms