Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.4 ms