Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMJ2

Fbxw4, F-box/WD repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw4Q9JMJ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw4Q9JMJ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms