Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrfQ9JM73 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms