Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Rabgef1Q9JM13 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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