Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms