Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gde1Q9JL56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms