Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms