Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk3aQ9JKX8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms