Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmx1aQ9JKU8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms