Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

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Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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