Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PigbQ9JJQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigbQ9JJQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms