Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms