Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssna1Q9JJ94 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssna1Q9JJ94 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms