Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms