Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms