Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem27Q9ESG4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms