Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenofQ9ERR7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SelenofQ9ERR7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms