Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms