Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slco1c1Q9ERB5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slco1c1Q9ERB5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms