Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms