Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r41Q9EQ44 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r41Q9EQ44 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms