Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr6Q9EQ16 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcr6Q9EQ16 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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