Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tspan4Q9DCK3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tspan4Q9DCK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tspan4Q9DCK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tspan4Q9DCK3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tspan4Q9DCK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tspan4Q9DCK3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tspan4Q9DCK3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tspan4Q9DCK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tspan4Q9DCK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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