Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop7Q9DCH2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop7Q9DCH2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms