Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1dQ9DC28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1dQ9DC28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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