Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms