Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms