Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asf1bQ9DAP7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms