Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgf29Q9DA08 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms